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Beacon 单细胞光导系统

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通过分析单细胞或克降的功能、表型和基因型,一次实验快速筛选几千到几万个单细胞,深入理解细胞功能,加速新疗法的开发。

一:技术原理:

布鲁克的光流控技术(Optofluidic Technology)是集纳升级微反应器技术(NanoPen™)光电定位技术( OptoelectroPositioning,OEP™)、及AI算法为一体的划时代数字细胞生物学技术。在一块CPU大小的半导体芯片上,单个活细胞可通过微反应器技术在纳升级的小室中进行培养及实验,并可通过光电定位技术进行灵活的导入和导出。细胞的性状、实验结果分析等通过AI算法精密计算,实现了全自动化操作。

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纳升级微反应器技术:OptoSelect芯片上有数千到上万个纳升级别的NanoPen小室,小室上方是试剂和细胞的通道,在培养基流动过程中,小室中的细胞和微珠等不会受到通道层流的干扰,小分子包括营养物质和代谢产物可以通过浓度梯度扩散实现细胞的持续培养,抗体和细胞因子等大分子则可以在十几分钟内在小室内积累到可被检测的浓度,从而实现对单个细胞快速表征。


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二:应用领域

1、抗病毒中和抗体发现

目前获得抗病毒中和抗体有三种策略:1,从康复病人血液中获得;2,用病毒蛋白免疫小鼠通过通过抗体发现过程获得;3,通过筛选人天然抗体库获得。其中通过第1种策略获得的中和抗体效果好,耗时短。将从康复病人血液中富集的B细胞进行单个B 细胞水平的筛选及测序,从而快速高效地获得抗病毒中和抗体。单个B细胞抗体发现具有很多优势,成为抗体发现领域的热门新方向,但受限于常规技术平台难以实现单个B细胞的分离,筛选和回收。Beacon 单细胞光导系统将单个B细胞导入到芯片中的纳升级培养小室(NanoPen)中后,可平行检测抗原特异性抗体的分泌,并进行相关功能性验证,并针对性的导出目标B细胞。配合下游的单细胞mRNA测序,可在两天内完成细胞表型筛选并得到相应的抗体重轻链序列。相较于传统的抗体制备技术, Beacon平台具有细胞利用率高,回收效率高,支持人源化,重链和轻链序列信息配对等优势。

2、抗体工程

抗体药物研发过程中,为使筛选后得到的抗体具有理想的结构和活性,往往需要进行多轮的改造和优化。如通过基因工程的手段对抗体基因进行加工改造、转染到工程细胞重新装配、并进行功能筛选和分析,以便确认该改造是否符合需求。传统转染后筛选需要数周时间,而Beacon 单细胞光导系统仅需 3-5 天即可实现,极大地节省了抗体工程优化流程的时间成本。

3、肿瘤免疫治疗

在肿瘤免疫治疗中,为了验证细胞的改造效率,优化治疗用细胞的剂量,业界一直在寻找一种可对改造后T淋巴细胞进行高效筛选验证的技术手段。Beacon 单细胞光导系统可以实现对T淋巴细胞进行特异性激活,并检测特定细胞因子的分泌,从而实现对T淋巴细胞的功能性筛选。筛选后导出T淋巴细胞,可配合下游的基因表达谱分析(gene profiling),T细胞受体测序(TCR sequencing),T 细胞受体改造(TCR engineering)等 手段,大幅提升筛选效率。

4、基因编辑

基因编辑技术是免疫学、细胞生物学等学科的重要研究手段,也是物种改良、疾病预防、治病治疗等领域的重要途径。常规基因编辑实验过程中,在转染后的筛选过程中,需要 1-2 个月进行大量铺板、利用成像或生化等手段进行单克隆筛选和鉴定,而 Beacon 单细胞光导系统仅需 5 天,即可在更大规模地全自动地筛选所需的目标克隆,即可提高实验效率、节省人力成本,也可得到更可靠详实的实验成果。

5、细胞共培养研究

体外细胞共培养(cell co-culture)技术能模拟体内生成的微环境,便于更好地观察细胞与细胞、细胞与培养环境之间的相互作用以及探讨药物的作用机制和可能的作用靶点。Beacon 单细胞光导系统因其精准的细胞操作和高通量,可以为体外细胞共培养提供更多研究手段,如细胞间的杀伤、吞噬、协同等实验策略。

6、细胞克隆和亚克隆

有限稀释,流式分选等方法是细胞克隆的常见手段,在将细胞分到数十块微孔板后,还需要人工通过显微镜逐个检查是否为单细胞、通过成像系统来判断或通过生化手段来鉴定,每轮需要 3-4 周,根据不同应用单克隆性要求的不同,需要采用1至2轮的克隆步骤,整个过程极其繁琐费时,且误操作可能性较大。而Beacon单细胞光导系统则可以在5天内实现全自动细胞克隆和回收,轻松获得单克隆比例达99.5%的优质克隆。其全程配备图像和影像记录,并可以设计功能性验证环节。利用Beacon单细胞光导系统在芯片上同样也可以进行亚克隆,只需将芯片上特定NanoPen中单克隆的部分细胞分离导出,扩大培养,便可轻松实现克隆与亚克隆的平行培养。

7、表型与基因型对应

表型和基因型的对应一直是免疫学和细胞生物学研究的痛点之一,具有操作复杂、准确度不高、需要耗费大量人力物力等困难。而Beacon单细胞光导系统由于可以定制化定向导出,可以解决这个问题。在完成对单克隆的表现检测后,Beacon支持将特定克隆进行定向导出,配合下游的基因测序数据,直接对接表型数据和基因型数据。同时,Beacon单细胞光导系统也支持对于单克隆的亚克隆的导出,在对部分亚克隆进行测序的同时,继续培养原单克隆,并进行更多的生化分析,极大的丰富了从同一单克隆样品中可获取的数据种类。


三:技术优势

1、精准无损的单细胞操作:可利用光电定位系统,同时轻松操作数千个单细胞,  并进行平行的培养,分析等研究。

2、通量高:可同时运行4张芯片,约50000个细胞。并支持多种芯片类型,灵活的满足不同通量的实验需求。

3、全自动:细胞导入,培养,克隆,亚克隆,检测,筛选全部为自动化流程,较大程度的避免了手工操作带来的可能误差或错误。

4、软件易用:触摸屏操作,图形化界面,实验流程设计灵活,直观,易上手。

5、大幅节省时间:单个B细胞抗体发现流程从常规3-6个月缩减至2天;克隆流程从常规2-3周缩减至约3天。

6、高灵敏度:常规单个细胞置于微孔板中,需要培养数周,达到一定密度后才能进行分泌蛋白等指标的检测;而Beacon每个NanoPen体积仅有0.5-1 nl,单个细胞置于其中,密度等同于1E6 cell/ml,因此易于检测,灵敏度高。


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